五條堀研究室

総合研究大学院大学・統合進化科学研究センター／統合進化科学コース

研究のトピック

ヒトという種がどのように成り立ったのか？という疑問に対して、２つのアプローチを考えています。そのアプローチとは、「ヒトの種特異的形質の進化を理解する事」と、「アフリカに出現したヒトの世界への拡散の過程を理解する事」の２つです。これらの進化の過程を主に分子進化学的手法と集団遺伝学的手法を用いてDNAレベルで解析します。

業績リスト

単一アミノ酸リピート

単一アミノ酸リピートが原因となる遺伝病には、中枢神経系と骨格形成に病変が出るものが多く知られています。これらの病変はヒト特異的形質である脳の大容量化と直立２足歩行に関連する事から、単一アミノ酸リピートの進化がヒトの進化を理解するカギになりうると期待しています。

遺伝病

日本国内や国外で様々な現代病を含む遺伝病の原因遺伝子のマーカーを探索するプロジェクトが進行中です。そこから生まれる大量のヒト遺伝的多型のデータを活用する事で、医学的データの人類進化学への還元を目指します。

古代DNA

古代DNA研究は、古代集団の遺伝的構成や現代集団との関係を明らかにすることで、人類の集団史の理解に革命をもたらしています。私たちは、日本列島の遺跡から得られた古代DNAを用いて東アジア集団の形成史について研究しています。

ヒト以外の研究

私たちの興味は、人類だけにとどまりません。これまでもヒト以外に、イヌ科、魚類、棘皮動物を含む脊椎動物を研究してきました。

People

大学院生、ポスドクを募集中です。全ゲノム塩基配列決定から、確率・統計をベースにした進化の理論、コンピュータを使ったゲノム情報の扱いまで、研究に必要な様々な知識やテクニックを一緒に勉強しましょう。

五條堀　淳

PI

業績リスト

(*) は責任著者を示す

Selected Publication List;

  • Ishiya K*, Mizuno F, Gojobori J* et al. (2024) High-coverage genome sequencing of Yayoi and Jomon individuals shed light on prehistoric human population history in East Eurasian bioRxiv 2024.08.09.606917
  • Gojobori, J. et al. (2024) Japanese wolves are most closely related to dogs and share DNA with East Eurasian dogs. Nat. Commun. 15, 1680
  • Xiaokaiti X. ...Gojobori J* et al. (2023) The history of ancient Japanese dogs revealed by mitogenomes. Anthr. Sci. 230617
  • Mizuno F, Gojobori J* et al. (2021) Population dynamics in the Japanese Archipelago since the Pleistocene revealed by the complete mitochondrial genome sequences. Scientific reports 11:12018-12018.
  • Gojobori J* (2020) Rare allele sharing in the East Asian. Archivio per l'Antropologia e la Etnologia 2020:53-754.
  • Nishiyama KV, Satta Y, Gojobori J* (2020) Do Genes Associated with Dyslexia of Chinese Characters Evolve Neutrally? Genes 11:658.
  • Gojobori J* et al. (2015) mtDNA diversity of the Zapotec in Mexico suggests a population decline long before the first contact with Europeans. J Hum Genet 60: 557-559.
  • Gojobori J* (2012) A commentary on the history of human populations in the Japanese Archipelago inferred from genome-wide SNP data with a special reference to the Ainu and the Ryukyuan populations. J Hum Genet 57, 753-754.
  • Yamamichi M, Gojobori J, Innan H*. (2012) An autosomal analysis gives no genetic evidence for complex speciation of humans and chimpanzees. Mol Biol Evol 29, 145-156.
  • Gojobori J and Ueda S*. (2011) Elevated evolutionary rate in genes with homopolymeric amino acid repeats constituting nondisordered structure. Mol Biol Evol 28:543-550.
  • Gojobori J and Innan H*. (2009) Potential of fish opsin gene duplications to evolve new adaptive functions. Trends Genet 25:198-202.
  • Gojobori J, Tang H, Akey JM, Wu CI*. (2007) Adaptive evolution in humans revealed by the negative correlation between the polymorphism and fixation phases of evolution. PNAS 104:3907-3912

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住所

神奈川県三浦郡葉山町上山口字間門1560-35

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gojobori_jun[at]soken.ac.jp