CURRICULUM VITAE of NAOKI IRIE

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   MEETINGS ORGANIZED
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PUBLICATIONS

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ORAL PRESENTATIONS


    [Invited] The hourglass model in comparative transcriptomics
    Phylogenetisches Symposium (2024.Nov.24) Jena, Germany

    [Invited] General tendency in animal embryonic evolution and possible mechanisms for limiting phenotypic diversity
    Joint seminar : Research Center for Integrative Evolutionary Science & Centre for Evolutionary and Organismal Biology (2024.Nov.6) Hangzhou, China

    [Invited] Potential genetic system limiting phenotypic diversification of animals
    International Conference of the Genetics Society of Korea / The 1st Asia Genetic Consortium Conference (2024.Oct.19) Pusan, South Korea

    [Invited] How early animal embryos diversified despite the following conserved bottleneck phase?
    EuroEvoDevo (2024.Jun.27) Helsinki

    [Invited] Filtering aspect of animal embryogenesis toward phenotypic diversification
    ICOB seminar (2024.Jan.31) Institute of Cellular and Organismic Biology, Taiwan

    [Invited] Does the bottle-neck of the developmental hourglass model really define body plan?
    The 3rd AsiaEvo (2023.Dec.17) SINGAPORE

    [Invited] Does the bottle-neck of the developmental hourglass model really define body plan?
    ICG-Ocean 2023 (2023.Oct.28) Qindao, CHINA

    [Invited] Stability and robustness could be contributing to long term conservation of vertebrates' body plan
    Virtual Human Development Project (2023.Jun.14) Online, CANADA

    [Invited] Organismal intrinsic factors possibly limiting evolutionary diversification
    Determinants of Rates of Origination, Extinction and Evolution (2022.Jun.28) Oslo, Norway

    [Invited] Possible intrinsic factors limiting animal body plan diversification
    Japanese Society of Developmental Biologists - Singapore Developmental Biology Society Joint meeting (2022.May.30) online

    [Organized] Can we predict evolutionary outcome of animal body plan?
    International Congress of Zoology (2021.Nov.24) South Africa, Cape Town (online)

    [Invited] Internal factors of biological system that biases evolutionary outcome
    ICG-16 (2021.Oct.28) Qindao(online)

    [Invited] Possible constraints by developmental robustness
    AsiaEvo (2021.Aug.16) Tokyo (online)

    [Invited, Plenary Session] Developmental robustness may bias macroevolutionary outcome
    17th Spanish Society for Developmental Biology Meeting (2020.Nov.19) Spain (online)

    [Organized] Potential double-edged sword effect of gene re-usage toward evolutionary diversification
    Molecular Biology Society of Japan, Workshop: Phenotypic evolvability (2019.Dec.4) Hakata, Japan

    [Invited] Possible bias toward micro- and macro-evolutionary conservation by developmental systems
    Worksho reconciling micro-macro evolution (2019.Oct.28) Oslo, Norway

    [Invited] Do echinoderm embryos follow hourglass-like divergence?
    ICG-Ocean 2019 (2019.Sep.22) Qindao, China

    [Invited] Haeckel’s recapitulation theory refuted by the hourglass model?
    112th Annual Meeting of the German Zoological Society, Jena, Germany (2019.)

    [Invited (Plenary session)] Development and Evolution
    SERB School in Evolutionary Biology (2019.Mar.14) Bengaluru, India

    [Invited (Plenary session)] The developmental hourglass model in animal embryogenesis
    Developmental Biology of Sea Urchin and other Marine Invertebrates 2018, (2018.Oct.19) Woods Hole, USA

    [Invited] “Cost of complexity” contributed to the vertebrate bodyplan conservation?
    Euro EvoDevo 2018, (2018.Jun.26) Galway, Ireland

    [Invited] Gene re-usages constrained the evolvability of animal bodyplan?
    EvoDevo Seminar series, Cambridge University, Dept. of Zoology (2018.May.16) Cambridge, UK

    [Organized] “Cost of complexity” hypothesis supported in animal embryonic evolution?
    The 1st AsiaEvo conference (2018.Apr.18) ShenZhen, China

    [Invited] In search for a general law of animal embryonic evolution?
    The 12th International Workshop on Advanced Genomics [12AGW] (2017.Jun.29) Hitotsubashi Hall, Tokyo, Japan

    [Organized] What are the potential mechanisms that made vertebrates’ bodyplan conserved?
    Symposium 03 - 50th Anniversary Meeting of Japanese Society of Developmental Biologists (2017.May.10) Tokyo, Japan

    [Invited] The developmental hourglass model: the law of embryonic evolution?
    From Genetic Networks to a Cellular Wiring Diagram (2017.Apr.26) Tokyo, Japan

    [Organized] What makes vertebrate embryos to follow the hourglass-like conservation?
    Joint meeting of the 22nd International Congress of Zoology and the 87th meeting of Zoologial Society of Japan (2016.Nov.18) Okinawa, Japan

    [INVITED] Why are vertebrates’ organogenesis stages evolutionarily conservative?
    Hot Spring Harbor Symposium (2016.Nov.2) Kyusyu Univ. Hakata, Japan

    Possible constraints on phenotypic evolvability of vertebrates
    1st B10K project Meeting, (2016, Oct.27) Beijing, China

    Potential developmental constraints on vertebrate bodyplan evolution
    EuroEvoDevo, (2016.Jul.28th) Uppsala, Sweden

    [INVITED] How can we explain conservative evolution of vertebrates’s body plan?
    Boston University, Seminar organized by Cynthia Bradham (2016.Apr.11), Boston, United States

    [Organized] Potential double bladed aspect of gene recruitment to morphological evolution.
    Japan Q-bio week (2016.Jan.11) Tokyo, Japan

    [INVITED] CDB Symposium 2015
    In search for more ancestral embryos (2015.Mar.25) Kobe, Japan

    [INVITED] OIST Winter Course "Evolution of Complex Systems" (OWECS) 2014
    Is the hourglass model, unified theory of Evo-Devo? (2014.Dec.12) Okinawa, Japan

    Evolutionary meanings of fish-like stages in our embryogenesis.
    Japan-Chile JSPS symposium "Genomic and epigenomic insights into vertebrate regeneration, development and evolution - Xenopus and fish as models" (2014.Nov.4), Santiago, Chile

    Easily changed early embryogenesis?
    X Meeting of the Spanish Society for Developmental Biology 2014, (2014.Oct.14), Madrid, Spain

    Remaining questions of the developmental hourglass model
    Euro EvoDevo 2014 (2014.Jul.24th), Vienna, Austria

    Is there a general rule for embryonic evolution of vertebrates?
    The second Strategical Meeting for Medaka Research, (2014.Apr.10), Seville, Spain

    General rule for the relationship between vertebrate ontogeny and phylogeny?
    Harvard University, Seminar organized by Abzanov lab(2014.Mar.28), Boston, United States.

    What is the general formulation of embryonic evolution?
    International Mini-Symposium, “Eco-Devo-Evo", (2014.Feb.22) Kyoto, Japan

    [INVITED] Turtle also follows the general formulation of Embryonic Evolution.
    ICG-8 (2013. Oct. 31st) ShenZhen, China.

    [INVITED] Vertebrates' basic body plan embedded in the waist of hourglass.
    Bottleneck in evolution and development, International Plenary Symposium, 15th Annual meeting of the Society of Evolutionary Studies, Japan. (2013.Aug.29, in English) Tsukuba, JAPAN

    Vertebrate phylotypic period as a source of basic body plan.
    International Society of Developmental Biology Conference 2013 (2013.Jun.19), Cancun, Mexico

    [Organized] Turtle Genomes: Body Plan Evolution from Vertebrate Phylotype
    Workshop: de novo genome projects of exotic creatures
    Plant and Animal Genome Conference Asia 2013 (2013.Mar.18), Singapore

    [INVITED]What the Hourglass tells us about Vertebrate Development and Evolution.
    CDB Symposium 2013 (2013.Mar.4, in English) Kobe, JAPAN

    Flexibility in early developmental system?~ quantification of evolutionary distance between embryos~
    The first annual Winter q-bio meeting (2013.Feb.19), Honolulu, United States.

    [INVITED] Relationship between Ontogeny and Phylogeny of vertebrates. German-Japan Colloquium -Cellular Biochemistry Shaping Animals- (2013.Jan.31), Karlsruhe, GERMANY.

    [INVITED] Re-formulating the Relationship Between Evolution and Development. The 7th International Conference on Genomics & Bio-IT APAC 2012 (2012.Nov.30), HongKong, CHINA.

    [Organized] Hopeful monster tackles the developmental hourglass model.
    Asia Pacific Developmental Biology Conference, EvoDevo satellite Meeting (2012.Oct.5), Taipei, TAIWAN

    [INVITED] Flexibility in early development? ~Molecular evidence for the developmental hourglass model~
    CAS(Chinese Academy of Sciences)-MPG (German Max Planck Society) Partner Institute for Computational Biology seminar (2012.Jul.24th), Shanghai, CHINA

    Molecular verification of the developmental hourglass model.
    Euro Evo-Devo 2012 (2012.Jul.11), Lisbon, PORTUGAL

    Tackling classic morphological questions with cutting edge technologies.
    BGI ShenZhen (2012.Jun.26, in English), Shenzhen, CHINA

    [INVITED] Transcriptome comparisons provides evolutionary clue for the vertebrate body plan
    Sanger Institute seminar (2011.Sep.14), Cambridge, UNITED KINGDOM

    [INVITED] Evolutionarily inflexible debvelopmental programs? -Transcriptome similarity supports vertebrate phylotypic hypothesis- Young Researchers Conference on Evolutionary Genomics (2011.Aug.1, in English) Tokyo, JAPAN

    [INVITED] Transcriptome similarity reveals developmental basis for vertebrate body plan. Society for Molecular Biology and Evolution, SMBE 2011 (2011.Jul.30,in English) Kyoto, JAPAN

    [INVITED] Evolutionarily constrained developmental programs? Vertebrate body plan and Developmental hourglass model
    Beijing Genomic Institute Hong Kong, (2011. Apr.26, in English) Hong Kong, CHINA

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    [Invited] なぜ動物の体の基本構造は進化的に変わりにくい？
    東北大学　個体ダイナミクスセミナーシリーズ (2023.Oct.5)

    [Invited] 脊椎動物に保存された発生機構を制御するシグナル伝達ネットワーク
    日本毒性学会 年会 (2023.Jun.20) パシフィコ横浜

    [Invited] 個体発生と系統発生（進化）の一般則解明からみえてきた”縛り”
    名古屋大学理学部生物学科 GTRセミナー (2022.Dec.21) 名古屋大学

    [Invited] maternal microchimerism：マウスにおける動物実験モデル
    母児間免疫病研究会 (2022.Jul.23) オンライン

    [Invited] 表現型進化は生物に内在する要因により制限される?
    葉山セミナー (2022.Jul.1) 総合研究大学院大学　葉山

    [Invited] 動物の解剖学的基本パターンはなぜ進化的に保守的なのか
    第127 回日本解剖学会総会・全国学術集会 (2022.Mar.27) オンライン

    [Organized] 動物表現型進化の予測にむけて
    ExCELLS シンポジウム (2020.Dec.21) オンライン

    [Organized] 発生頑健性による進化の慣性力
    日本分子生物学会 (2021.Dec.1) 横浜

    [Invited] 現代の生物学I
    神戸大学　大学院生物専攻特別講義　(2021.Jul.11) 神戸(オンライン)

    [Invited] 発生頑健性による進化の慣性力
    日本分子生物学会 (2021.Dec.1) 横浜

    [Organized] 動物ボディプランにみられる進化的慣性力の仕組みは？
    日本進化学会年会 (2020.Sep.7) オンライン

    [Organized] 遺伝子の使い回しは多様化にとって諸刃の剣か 日本分子生物学会 (2020.Dec.4)博多

    [Organized] What makes animal embryos to follow the hourglass model?
    日本生物物理学会　 (2019.Sep.25) 宮崎

    [INVITED] 遺伝子の使い回しは進化にとって諸刃の剣か？
    再生学異分野融合研究会　 (2018.Aug.31) 基生研

    [Organized] 表現型揺らぎから探る進化の方向性と拘束
    日本進化学会 (2018.Aug.23) 東京

    [INVITED] 複雑な遺伝子制御を持つ動物ほど進化可能性が低いかもしれない
    生命の起源および進化学会 (2018.Mar.16) 埼玉大学

    脊索動物胚発生の分子発生システムゆらぎと進化的保存性の関連解明に向けて
    新学術領域　進化制約方向性 キックオフシンポジウム (2017.Oct.1) 東京大学

    MFID仮説検証を目指した動物実験系の立ち上げ
    母児間免疫病研究会 2017年大会(2017.Jul.15) 大阪市立大学

    What are the potential mechanisms that made vertebrates‘ bauplan conserved?
    日本発生生物学会　50周年記念大会 (2017.May.10) Tokyo

    In search for general law of animal embryonic evolution
    International Symposium on Universal Biology [東京大学　生物普遍性研究機構　主催] (2016.Nov.28) 東京大学

    [Organized] なぜボディプラン進化は保守的なのか
    シンポジウム　進化可能性と方向性：実験と理論からのアプローチ　日本進化学会 (2016.Aug.27) 東工大

    [INVITED] 動物発生の進化的法則性を求めて
    研究会　物理学的普遍性から生物学的普遍性へ 　（2016.Aug.5) 東京

    [INVITED] 発生システムが動物ボディプラン進化を制約している可能性
    BMB2015(第38回日本分子生物学会年会、第88回日本生化学会大会 合同大会)　　
    ワークショップ　生体反応システムの頑強性と進化可能性（2015.Dec.3) 神戸

    [INVITED] 大進化スケールにおける発生進化の法則性と定量的検証る可能性
    平成27年度 JSBi生命システム理論研究会　〜細胞システムの機能獲得と進化のメカニズム〜
    （AMED再生医療実現ネットワーク併催）（2015.Nov.27) 東京医科歯科大学

    [INVITED] 動物胚が発生と進化の法則性、砂時計モデルに従うのはなぜか？
    第53回　生物物理学会年会　　シンポジウム大自由度ダイナミクスから“生きている状態”の記述へ（2015.Sep.14) 金沢

    [Organized] 動物進化と個体発生の統合的理解に向けて
    第37回　分子生物学会　Workshop 2W11 生態進化発生学(EcoEvoDevo) とは言うけども (2014.Nov.26) 横浜

    [INVITED] 大規模トランスクリプトームから挑む進化発生学の古典問題
    第86回　日本遺伝学会 年会 (2014.Sep.19)長浜

    [INVITED] 祖先の姿を反映した発生期?EvoDevo の古典問題と生命情報解析
    遺伝研研究集会「ゲノム編集時代の分子進化」 (2014.Jun.28-29) 三島

    [Organized] カメも従う動物発生進化の法則性？
    第36回　分子生物学会 Workshop 3AW14 (2013.Dec.5) 神戸

    [INVITED] Flexibility in early animal developmental system.
    The 2nd International Workshop for Quantitative Biology (2013.Nov.25) Osaka

    [INVITED] 脊椎動物の進化と発生の関係性を解明したい
    京都大学　理学研究科セミナー　京都大学大学院理学研究科　(2013.Oct.25) 京都

    [INVITED] ネッタイツメガエル胚発生期の包括的遺伝子発現データ
    第84回　動物学会　(2013.Sep.28) 岡山

    [INVITED] 進化と発生の関係性をさぐるべく、de novo カメゲノム
    NGS現場の会　第３回大会 (2013.Sep.4) 神戸

    [INVITED] 個体発生は系統発生を繰りかえさない
    京都大学　再生医科学研究所　再生増殖制御学セミナー　 (2013.Jul.22) 京都

    [INVITED] カメも従う発生進化の法則性
    新学術領域「複合適応形質進化の遺伝子基盤解明」第6回オープンセミナー (2013.Jun.1) 富山

    [INVITED] カメゲノムと脊椎動物ボディプラン
    第60回　日本実験動物学会総会　(2013.May.16) つくば

    [INVITED] 発生システムのゆらぎと進化的可変性の理解にむけて
    QBiC 定量オミックスワークショップ @OLABB (2013.Jan.22) 大阪 [PDF]

    [Organized] 進化と発生にどういう関係がある？
    第35回　分子生物学会 Workshop 3W6II-1 (2012.Dec.13) 博多

    [INVITED]「脊椎動物よ、もうその基本ボディプランは変形させられないのか？」
    生命医薬情報学連合大会合同シンポジウム「これからの生命科学を考える」　(2012.Oct.15-16) 東京

    [INVITED] 個体発生と系統発生が示す新たな謎
    Emerging question from ontogeny and phylogeny of animals
    第24回 高遠シンポジウム、(2012.Aug.24) 長野

    [INVITED] 大量情報解析技術で挑む進化発生学の古典問題
    NAIST植物グローバル 平成24年度ワークショップ「実験生物学と情報学的アプローチのシームレスな融合」
    (2012.Jun.13) 奈良

    Reconsidering the mechanistic view of embryogenesis
    Joint Meeting of JSDB 45th & JSCB 64th (2012.May.31 in English) Kobe

    NGS技術で生命史観は変わりますか？〜進化と発生の観点から〜
    2nd Meeting of Next Generation Sequencer Field (2012.May.25) Osaka

    [INVITED] 大量情報解析から挑む脊椎動物ボディプラン
    第117回日本解剖学会総会 (2012.Mar.28) 甲府

    [Science communication] 解くべき問題を見出す
    参加型サイエンストーク 見出す物語 (2012.Mar.12) 横浜 [pdf] [link]

    [INVITED] ヘッケルの反復説から進化と発生の関係性解明は進んだか？
    京都大学医学部　生体構造医学セミナー　(2012.Jan.19) 京都 [pdf]

    [INVITED] 観念形態学の古典問題に定量化で挑む
    4th Annual meeting of Japanese Society for Quantitative Biology (2012.Jan.9) Nagoya, Japan

    [INVITED] Haeckel’s recapitulation theory? or The developmental hourglass?
    The 1542th Biological Symposium at National Institute of Genomics.
    (2011.Nov.21, in English) Mishima, Japan

    個体発生と系統発生からみた脊椎動物ボディプラン
    新学術領域研究「複合適応形質進化の遺伝子基盤解明」 第2回 若手ワークショップ (2011.Oct.7) 千葉

    進化発生学の古典問題にバイオインフォマティクスで挑む
    生命情報科学若手の会　沖縄セミナー(2011.Sep.3) Okinawa

    [INVITED] 発生砂時計モデルの証明と脊椎動物EvoDevo最前線
    大阪大学微生物病研究所 第14回 Bridge Seminar Series 微研部員会主催セミナー (2011.Jun.17) 大阪

    [INVITED] 発生砂時計モデルと脊椎動物がもつ発生学的構造特性への思索
    東京大学金子研究室 (2011.Jun.16) 東京

    [INVITED] 脊椎動物胚でみつかった進化的に保守的な胚段階
    神戸大学GCOE セミナー (2011.May.24) 神戸

    [INVITED] The developmental hourglass model and early divergence of vertebrate embryos. 44th Annual Meeting of JSDB, 2011, (2011.May.21, in English) OKINAWA

    Testing phylotype hypothesis and structural insights of vertebrate embryogenesis
    BMB 2010, 1T7-8 & 1P-1139, (2010.Dec.7, in Japanese) 神戸

    脊椎動物ファイロタイプ仮説検証と発生学的構造特性の示唆
    生命情報科学若手の会　第２回研究会（2010.Oct.9, in Japanese）三島

    胆道閉鎖症における母児間のHLA一致度 一般演題,第３４回日本胆道閉鎖症研究会 (2008.4.20, in Japanese)名古屋

    第2回 母児間免疫病勉強会　講演 「MFID仮説検証におけるTreg ablationの実験系について」
    (2010.Mar.20, in Japanese)　大阪　関西医科大学

    第１回 母児間免疫病勉強会　講演 「現代免疫学〜母児間免疫を中心に〜」
    (2009.Jun.19, in Japanese)大阪　関西医科大学




  RESEARCH GRANT

2023.Apr
-2025.Mar
二国間交流事業　
脊椎動物胚に保存されたボディプラン構成細胞の解明
Bilateral Program
"Clarifying the cellular components of vertebrate body plan"                             
2023.Apr
-2027.Mar
基盤(B) 代表　
ボディプラン解明と動物門の発生学的定義法
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
"Identification of body plan and developmental re-definition of animal phylum"                             
2021.Apr
-2024.Mar
挑戦的研究(萌芽) 代表　
胎児期に移入する母由来細胞集団の解明とその生物学的意義の探求
Challenging Research (Exploratory)
"Identification of maternal cell types migrated during development and in search for their biological roles "                             
2020.Aug.31
武田科学振興財団     
妊娠期に移入する母由来・非自己細胞の胎仔における細胞腫と分布解明                           
Takeda Science Foundation                                                                                                                                                                 
2017.Jun
-2022.Mar
新学術領域研究（領域提案型）計画班代表　
進化の制約と方向性　　
Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (proposed research area)
"Measuring molecular fluctuations of chordate developmental system and their relationship toward evolutionary conservation"
2017.Apr
-2020.Mar
挑戦的研究(萌芽) 代表　
胆道閉鎖症への母児間マイクロキメリズムの関与検証
Challenging Research (Exploratory)
"Testing possible contribution of maternal microchimeric cells to biliary atresia"                             
2016.Apr
-2017.Mar
中島記念国際交流財団　
発生システムのロバスト性評価による、動物発生進化の保守性解明
The Nakajima Foundation
"Tackling Conservative features of animal embryonic evolution by evaluation of developmental robustnessTesting possible contribution of maternal microchimeric"                             
2015.Nov
-2019.Mar
JST 戦略的国際共同研究プログラム　
棘皮動物と脊索動物の発生プログラムから目指す遺伝的進化度の構築
JST Strategic International Collaborative Research Program (SICORP) Japanese-Chinese Research Cooperative Program
"Genetic degree of evolution in Echinoderm and Chordate developmental programs"
2015.Apr.
-2016.Mar
武田科学振興財団     
母児間マイクロキメリズムと先天異常発症                            
Takeda Science Foundation                                                                                                                                                                 
2015.Apr.
-2018.Mar
若手研究 (A)　代表
発生時系列ゲノム情報展開から目指す脊索動物胚進化の一般則解明
KAKENHI Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
"In search for a general tendency of chordate embryonic evolution by analyzing genetic expression patterns during development"
2013.Aug
-2017.Mar
複雑生命システム動態研究教育拠点　                                                        
                                          
Research & Education Platform for Dynamic Living States                                               
                                                                
2012.Apr
-2015.Mar
基盤研究 (C)　代表　
脊椎動物胚発生の進化発生学的理解を目指す
KAKENHI Grant-in-Aid for Scientific Research (C), #24570243
"In search for a general tendency of chordate embryonic evolution by analyzing genetic expression patterns during development"
2010.Apr
-2015.Mar
新学術領域研究（領域提案型）計画班分担者　
カメの甲の新規形態パターンをもたらした発生機構の変化
Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (proposed research area)
"Changes in developmental program in the acquisition of novel morphological patterns of the turtle shell"
2009.Apr
-2011.Mar
若手研究 (B) 代表
トランスクリプトーム解析によるファイロティピック段階の実体解明
KAKENHI Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
"Identification of vertebrate phylotypic stage by transcriptome analysis"
2007.Apr
-2008.Mar
萌芽研究 研究協力者
脊椎動物の発生拘束を担う遺伝子群の同定とその役割             
KAKENHI Grant-in-Aid for Exploratory　Research                            
"Identification of genes involved in constrained stages of vertebrates"                              


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  MEETINGS ORGANIZED

2024
第26回　日本進化学会　年会 大会組織委員
The 26th Annual meeting of Society of Evolutionary Studies, Japan.
2023
The 3rd AsiaEvo, Scientific Committee @Singapore
2022
第93回　日本動物学会　(早稲田大会) 大会組織委員
The 93rd Annual meeting of the Zoological Society, Japan.
2021
The 2nd AsiaEvo, Scientific Committee
2020
日本発生生物学会年会 オンライン大会　準備委員
Online meeting of the Japanese Society for Developmental Biologists
2020
日本進化学会 オンライン大会　プログラム委員
Online meeting of the Society of Evolutionary Studies, Japan
2018
The 1st AsiaEvo 発起人, プログラム委員
The 1st AsiaEvo (Co-promoter, scientific committee)
2017
第50回　日本発生生物学会年会　準備委員
（プログラム委員長）
50th meeting of the Japanese Society for Developmental Biologists (Chair of Program Committee)
2015
第15回　日本進化学会年会　大会準備委員
15th Meeting of Society of Evolutionary Stdies, Japan (Organizing committee)
2013
第36回　日本分子生物学会年会　組織委員
The 36th Annual meeting of Molecular Biology Society of Japan (Organizing committee)
2012
第35回　日本分子生物学会年会　組織委員（IT委員会）
The 35th Annual meeting of Molecular Biology Society of Japan (IT committee)
2012
第2回　NGS現場の会　副大会長
2012
第1回　NGS現場の会　創設メンバー
2008
第1回　母児間免疫病研究会　発起人
1st meeting of the Materno-Fetal Immune disease
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  TEACHING / LECTURES


講義


個体ダイナミクスセミナーシリーズ
東北大学 生命科学研究科 (2023.Oct.5)

動物発生学実習
東京大学　理学部　生物学科　(FY2013-FY2022)

進化発生生物学
東京大学　理学部　生物学科　(FY2013-FY2023)

進化生物学
　東京大学　教養学部前期・後期 (FY2017-FY2022)

現代生物学
　東京大学　教養学部前期・後期 (FY2017, 2019, 2022)

全学体験ゼミナール
東京大学　教養学部前期・後期

発生学特論
東京大学　大学院理学系研究科　生物科学専攻 (FY 2014-2022)

現代の生物学
神戸大学　大学院理学系研究科 生物学専攻 (2021.Jun.11)

個体発生は系統発生を繰り返さない
鳥取大学　医学部 (2018.Nov.6)

[Statistics, R] 統計の考え方入門
大阪市立大学医学部 (2018.Jul.15)

Lecture at Kunming Institute of Zoology
"General relationship between ontogeny and phylogeny?" (2015.Sep.28), Kunming, China

[Statistics, R] 数式なしの統計入門と『R』を使った実際
ImageJ + R ハンズオン実習2014 平成26年度NAIST 植物グローバル教育プロジェクト(2014.Jun.12)

[EvoDevo]個体発生は系統発生をくりかえさない
慶應義塾大学 鶴岡キャンパス 概念構築講義 (2014.May.13) 鶴岡 慶應義塾大学

[Bioinformatics] カメ de novo ゲノムとRNAseqデータの異種間比較
第27回　DDBJing講習会 日本DNAデータバンクジャパン(DDBJ)主催 (2013.Jul.4) 三島　国立遺伝学研究所

[Statistics, R lecture] 数式なしの統計講座、そしてRソフトでの実際
やってみようよ！画像、統計、ゲノム・トランスクリプトーム解析ハンズオン実習 (2013.Jul.6) Nara Institute of Science and Technology

[NGS lecture] 新規脊椎動物ゲノム同定とRNAseqによる遺伝子発現プロファイル比較
次世代シーケンシングが切り開く医学研究と展望 (2012.Jul.31) Kyoto University Center for iPS Research and Application

[Bioinformatics lecture] 統計の初歩の初歩 ~検定はRプログラムで全部できます~
入江直樹 インフォマティクスセミナー　京都大学 Center for iPS Cell Research and Application (2012.Jan.19) 京都 [handbill]

[Statistics/Bioinformatics Hands-on lecture] 統計解析ソフトRとその活用：統計の誤用でこけないために
入江直樹　生命情報科学若手の会　沖縄セミナー 2011 (2011.Sep.2) Okinawa

Basic Medicine, Medical Biology course for pre-med students at Daigakuin-Yobiko
(3 classes/week 2008.Aug. - 2009.Mar.)

　 Kyoto University Graduate School of Medicine/Biostudies/Science/Agriculture cross sectoral study sessions
(2008.Feb.12, 2008.Nov.14, 2009.Mar.5, all INVITED)



一般公開講演・メディア出演など（ニュースは除く）


学術会議フォーラム 2040年の科学・学術と社会を見据えて取り組むべき10の課題
～イノベーション・越境研究・地域連携・国際連携・人材育成・研究環境～ 2023年7月2日

NHK BSプレミアム ヒューマニエンス 「“出産”　ヒトは難産を選んだ」2020年4月22日

東京大学新聞 2020年 6月2日号

進化発生生物学って何？
　国際生物オリンピック日本委員会 (2018.Aug.18), 東京

[フロントランナー挑む]　生物の進化を予測する　
日経サイエンス 2018 ６月号

胎児期に刻まれた進化の痕跡
　関東支部公開講演会「塗り替えられる動物の進化の歴史」 (2017.Jul.22nd), 東京

聞こう！語ろう！考えよう！ かたちの変化と生きものの進化
　JT生命誌研究館 (2016.Aug.20th), 大阪

第27回東大理学部公開講演会「理学の真実」(2015.Nov.20)
東京大学　理学部オープンキャンパス2015

National Geographic Nov. 2013 理化学研究所　参加型サイエンストーク　「見出す」物語　2013

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  PEER REVIEW EXPERIENCES





 

  ADVISORY ROLES

2022 - present
Society for Evolutionary Studies, Japan (日本進化学会)
Board member (理事)
2022 - present
Zoological Society of Japan, Kanto branch (日本動物学会 関東支部)
Branch committee representative（支部代表委員)
2021 - present
The Japanese Society of Developmental Biologists (日本発生生物学会)
Board member (理事)
2020- present
日本学術会議 (Science council of Japan)
Member (連携会員)
2020- present
Center for Excellence in Animal Evolution and Genetics
 Chinese Academy of Sciences
International Evaluator (国際外部評価委員)
2019 - present
PRESTO "Multicellular system
 さきがけ「多細胞」(JST/戦略的創造研究推進事業)
Advisor (アドバイザー)
2018 - 2022
Zoological Society of Japan, Kanto branch (日本動物学会 関東支部)
Committee member (委員)
2018 - 2020
Society for Evolutionary Studies, Japan (日本進化学会)
Inspector (監事)
2016 - 2018
The 1st AsiaEvo Conference
Co-Promoter, Scientific Committee (発起人、プログラム委員)
2017 Jan - present
Journal of Experimental Zology, Part B
Associate Editor
2016 Jan - present
Zoological Letters
Associate Editor
2016 Jan - 2016 Dec
The Japanese Society of Developmental Biologists (日本発生生物学会)
Secretary-general (幹事長)
2013 Jan - 2015 Dec
The Japanese Society of Developmental Biologists (日本発生生物学会)
Deputy secretary-general (副幹事長)
2016 Jan - 2017 Dec
Society for Evolutionary studies, Japan (日本進化学会)
Councilor (評議員)
2014 Jan - 2015 Dec
Society for Evolutionary studies, Japan (日本進化学会)
Executive member (執行部)
2012 Apr - 2015 Apr
Japanese Society for Quantitative Biology (定量生物の会)
core-member
2010 Jul - 2015
Faculty of 1000
Associate Faculty
2009 - present
Study group for Materno-fetal Immune disease　(母児間免疫病研究会)
Co-Promoter (発起人)

  NEWS PAPERS/ MEDIA etc.

テック・アイ研究所 (2022年 Nov.9日) 新生仔に入り込んだ母由来細胞は、免疫の制御に寄与する

日経新聞 (2022年 Nov.4日) 東大、胎児期に移入する母由来細胞種の個体ごとの違いや全貌を解明

日経新聞 (2022年 Apr.22日)

NHK ヒューマ二エンス ”出産 ヒトは難産を選んだ” 初回放送日 2021年4月22日

　　 日経サイエンス2018年６月号「挑む」 p.8-11

日経新聞、財経新聞、Yahoo!ニュース、BIGLOBEニュース、ライブドアニュース、ニフティニュース etc. (2017.Feb.8)

日経新聞、朝日新聞、毎日新聞、産経新聞、読売新聞、NNNニュース etc. (2013.Apr.29)

研コミュ白書　NGS現場の会 (荒川和晴、入江直樹、谷上賢瑞、中村昇太）

細胞工学 vol.31 No.9 (2012) p.1060-1063 NIKKEI Newspaper

日本経済新聞 (日曜朝刊・科学欄) ~ナゾ科学~ 阿修羅や八岐大蛇、なぜいない？　2011.Jul.10 (in Japanese)
>RIKEN Research [PDF] 2011.June Vol.6 Num. 6

科学新聞 4月15日夕刊：「脊椎動物の進化的に保存された発生段階は咽頭胚期 –理研スパコン使って明らかに-」
RIKEN News 2011.Mar.30 (in Japanese)

新学術領域・複合適応形質進化の遺伝子基盤解明 ニュースレター Vol.2 No. S1 号外 [PDF] (in Japanese)




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