Academic Positions
2026 Apr. – Current
2024 Apr. – 2026 Mar.
2023 Apr. – Current
2013 Aug. – 2023 Mar.
Associate Professor
Department of Biological Sciences, Graduate School of Science, University of Tokyo
Department of Biological Sciences, Graduate School of Science, University of Tokyo
2017 Aug. – 2023 Mar.
Associate Professor
Universal Biology Institute, University of Tokyo
Universal Biology Institute, University of Tokyo
2013 Jun. – Sep.
Part-time Lecturer
NAIST Graduate School of Biological Science
NAIST Graduate School of Biological Science
2009 Apr. – 2013 Aug.
2008 Apr. – 2009 Mar.
Postdoctoral Fellow
Congenital Anomaly Research Center, Graduate School of Medicine, Kyoto University
Congenital Anomaly Research Center, Graduate School of Medicine, Kyoto University
2005 Apr. – 2008 Mar.
JSPS Research Fellow (DC1)
Education
2008 Mar.
Ph.D., Graduate School of Medicine,
Kyoto University, Japan
2004 Mar.
Master of Medical Science, Graduate School of Medicine, Kyoto University, Japan
2002 Mar.
Bachelor of Science, Kobe University, Japan
1999 Jul. – Aug.
2 credits in Biology, University of California, San Diego
1991 – 1992
College Ave. Public Junior High School (Guelph), Canada
Publications
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Oral Presentations
International Conferences / Meetings
- InvitedWhich cell types are more evolutionarily conserved in the vertebrate body plan? — Molecular Biology Society of Japan (2025 Dec. 4), Yokohama, Japan
- InvitedGeneral tendency in animal embryonic evolution — Light of Evolution Academic Cloud Forum, Beijing University (2024 Dec. 25), Beijing, China
- InvitedThe hourglass model in comparative transcriptomics — Phylogenetisches Symposium (2024 Nov. 24), Jena, Germany
- InvitedGeneral tendency in animal embryonic evolution and possible mechanisms for limiting phenotypic diversity — Joint seminar: RCIES & Centre for Evolutionary and Organismal Biology (2024 Nov. 6), Hangzhou, China
- InvitedPotential genetic system limiting phenotypic diversification of animals — International Conference of the Genetics Society of Korea / 1st Asia Genetic Consortium Conference (2024 Oct. 19), Pusan, South Korea
- InvitedHow early animal embryos diversified despite the following conserved bottleneck phase? — EuroEvoDevo (2024 Jun. 27), Helsinki
- InvitedFiltering aspect of animal embryogenesis toward phenotypic diversification — ICOB Seminar (2024 Jan. 31), Institute of Cellular and Organismic Biology, Taiwan
- InvitedDoes the bottle-neck of the developmental hourglass model really define body plan? — The 3rd AsiaEvo (2023 Dec. 17), Singapore
- InvitedDoes the bottle-neck of the developmental hourglass model really define body plan? — ICG-Ocean 2023 (2023 Oct. 28), Qingdao, China
- InvitedStability and robustness could be contributing to long-term conservation of vertebrates' body plan — Virtual Human Development Project (2023 Jun. 14), Online, Canada
- InvitedOrganismal intrinsic factors possibly limiting evolutionary diversification — Determinants of Rates of Origination, Extinction and Evolution (2022 Jun. 28), Oslo, Norway
- InvitedPossible intrinsic factors limiting animal body plan diversification — JSDB–Singapore Developmental Biology Society Joint Meeting (2022 May 30), online
- OrganizedCan we predict evolutionary outcome of animal body plan? — International Congress of Zoology (2021 Nov. 24), Cape Town, South Africa (online)
- InvitedInternal factors of biological system that biases evolutionary outcome — ICG-16 (2021 Oct. 28), Qingdao (online)
- InvitedPossible constraints by developmental robustness — AsiaEvo (2021 Aug. 16), Tokyo (online)
- Invited (Plenary)Developmental robustness may bias macroevolutionary outcome — 17th Spanish Society for Developmental Biology Meeting (2020 Nov. 19), Spain (online)
- OrganizedPotential double-edged sword effect of gene re-usage toward evolutionary diversification — Molecular Biology Society of Japan, Workshop: Phenotypic evolvability (2019 Dec. 4), Hakata, Japan
- InvitedPossible bias toward micro- and macro-evolutionary conservation by developmental systems — Workshop: Reconciling Micro-Macro Evolution (2019 Oct. 28), Oslo, Norway
- InvitedDo echinoderm embryos follow hourglass-like divergence? — ICG-Ocean 2019 (2019 Sep. 22), Qingdao, China
- InvitedHaeckel's recapitulation theory refuted by the hourglass model? — 112th Annual Meeting of the German Zoological Society, Jena, Germany (2019)
- Invited (Plenary)Development and Evolution — SERB School in Evolutionary Biology (2019 Mar. 14), Bengaluru, India
- Invited (Plenary)The developmental hourglass model in animal embryogenesis — Developmental Biology of Sea Urchin and other Marine Invertebrates 2018 (2018 Oct. 19), Woods Hole, USA
- Invited"Cost of complexity" contributed to the vertebrate body plan conservation? — Euro EvoDevo 2018 (2018 Jun. 26), Galway, Ireland
- InvitedGene re-usages constrained the evolvability of animal body plan? — EvoDevo Seminar Series, Cambridge University (2018 May 16), Cambridge, UK
- Organized"Cost of complexity" hypothesis supported in animal embryonic evolution? — The 1st AsiaEvo Conference (2018 Apr. 18), Shenzhen, China
- InvitedIn search for a general law of animal embryonic evolution — 12th International Workshop on Advanced Genomics (2017 Jun. 29), Tokyo, Japan
- OrganizedWhat are the potential mechanisms that made vertebrates' body plan conserved? — 50th Anniversary Meeting, Japanese Society of Developmental Biologists (2017 May 10), Tokyo, Japan
- InvitedThe developmental hourglass model: the law of embryonic evolution? — From Genetic Networks to a Cellular Wiring Diagram (2017 Apr. 26), Tokyo, Japan
- OrganizedWhat makes vertebrate embryos follow the hourglass-like conservation? — ICZ & Zoological Society of Japan Joint Meeting (2016 Nov. 18), Okinawa, Japan
- InvitedWhy are vertebrates' organogenesis stages evolutionarily conservative? — Hot Spring Harbor Symposium (2016 Nov. 2), Hakata, Japan
- Possible constraints on phenotypic evolvability of vertebrates — 1st B10K Project Meeting (2016 Oct. 27), Beijing, China
- Potential developmental constraints on vertebrate body plan evolution — EuroEvoDevo (2016 Jul. 28), Uppsala, Sweden
- InvitedHow can we explain conservative evolution of vertebrates' body plan? — Boston University, Seminar organized by C. Bradham (2016 Apr. 11), Boston, USA
- OrganizedPotential double-bladed aspect of gene recruitment to morphological evolution — Japan Q-bio Week (2016 Jan. 11), Tokyo, Japan
- InvitedIn search for more ancestral embryos — CDB Symposium 2015 (2015 Mar. 25), Kobe, Japan
- InvitedIs the hourglass model, a unified theory of Evo-Devo? — OIST Winter Course "Evolution of Complex Systems" (2014 Dec. 12), Okinawa, Japan
- Evolutionary meanings of fish-like stages in our embryogenesis — Japan-Chile JSPS Symposium (2014 Nov. 4), Santiago, Chile
- Easily changed early embryogenesis? — X Meeting, Spanish Society for Developmental Biology (2014 Oct. 14), Madrid, Spain
- Remaining questions of the developmental hourglass model — Euro EvoDevo 2014 (2014 Jul. 24), Vienna, Austria
- Is there a general rule for embryonic evolution of vertebrates? — 2nd Strategical Meeting for Medaka Research (2014 Apr. 10), Seville, Spain
- General rule for the relationship between vertebrate ontogeny and phylogeny? — Harvard University, Seminar organized by Abzhanov lab (2014 Mar. 28), Boston, USA
- What is the general formulation of embryonic evolution? — International Mini-Symposium "Eco-Devo-Evo" (2014 Feb. 22), Kyoto, Japan
- InvitedTurtle also follows the general formulation of embryonic evolution — ICG-8 (2013 Oct. 31), Shenzhen, China
- InvitedVertebrates' basic body plan embedded in the waist of the hourglass — 15th Annual Meeting, Society of Evolutionary Studies Japan (2013 Aug. 29), Tsukuba, Japan
- Vertebrate phylotypic period as a source of basic body plan — International Society of Developmental Biology Conference 2013 (2013 Jun. 19), Cancun, Mexico
- OrganizedTurtle Genomes: Body Plan Evolution from Vertebrate Phylotype — Plant and Animal Genome Conference Asia 2013 (2013 Mar. 18), Singapore
- InvitedWhat the Hourglass tells us about Vertebrate Development and Evolution — CDB Symposium 2013 (2013 Mar. 4), Kobe, Japan
- Flexibility in early developmental system? — 1st Annual Winter Q-bio Meeting (2013 Feb. 19), Honolulu, USA
- InvitedRelationship between Ontogeny and Phylogeny of vertebrates — German-Japan Colloquium (2013 Jan. 31), Karlsruhe, Germany
- InvitedRe-formulating the Relationship Between Evolution and Development — 7th International Conference on Genomics & Bio-IT APAC 2012 (2012 Nov. 30), Hong Kong, China
- OrganizedHopeful monster tackles the developmental hourglass model — Asia Pacific Developmental Biology Conference, EvoDevo satellite (2012 Oct. 5), Taipei, Taiwan
- InvitedFlexibility in early development? — CAS-MPG Partner Institute for Computational Biology Seminar (2012 Jul. 24), Shanghai, China
- Molecular verification of the developmental hourglass model — Euro Evo-Devo 2012 (2012 Jul. 11), Lisbon, Portugal
- Tackling classic morphological questions with cutting-edge technologies — BGI Shenzhen (2012 Jun. 26), Shenzhen, China
- InvitedTranscriptome comparisons provide evolutionary clues for the vertebrate body plan — Sanger Institute Seminar (2011 Sep. 14), Cambridge, UK
- InvitedEvolutionarily inflexible developmental programs? — Young Researchers Conference on Evolutionary Genomics (2011 Aug. 1), Tokyo, Japan
- InvitedTranscriptome similarity reveals developmental basis for vertebrate body plan — SMBE 2011 (2011 Jul. 30), Kyoto, Japan
- InvitedEvolutionarily constrained developmental programs? — Beijing Genomic Institute Hong Kong (2011 Apr. 26), Hong Kong, China
Japanese Conferences / Meetings
- Invited動物進化は変幻自在ではない・・けど、なぜ？？ — 北里大学 理学部セミナー (2025 Nov. 13)
- Invited動物発生過程と情報科学からみた進化可能性とその課題 — 「進化可能性変動史」セミナーシリーズ 第一回 (2025 Nov. 5)
- Invitedなぜ動物の体の基本構造は進化的に変わりにくい？ — 東北大学 個体ダイナミクスセミナーシリーズ (2023 Oct. 5)
- Invited脊椎動物に保存された発生機構を制御するシグナル伝達ネットワーク — 日本毒性学会 年会 (2023 Jun. 20), パシフィコ横浜
- Invited個体発生と系統発生（進化）の一般則解明からみえてきた"縛り" — 名古屋大学理学部生物学科 GTRセミナー (2022 Dec. 21)
- Invitedmaternal microchimerism：マウスにおける動物実験モデル — 母児間免疫病研究会 (2022 Jul. 23), オンライン
- Invited表現型進化は生物に内在する要因により制限される？ — 葉山セミナー (2022 Jul. 1), 総合研究大学院大学
- Invited動物の解剖学的基本パターンはなぜ進化的に保守的なのか — 第127回日本解剖学会総会・全国学術集会 (2022 Mar. 27), オンライン
- Organized動物表現型進化の予測にむけて — ExCELLS シンポジウム (2020 Dec. 21), オンライン
- Organized発生頑健性による進化の慣性力 — 日本分子生物学会 (2021 Dec. 1), 横浜
- Invited現代の生物学I — 神戸大学 大学院生物専攻特別講義 (2021 Jul. 11), 神戸 (オンライン)
- Organized動物ボディプランにみられる進化的慣性力の仕組みは？ — 日本進化学会年会 (2020 Sep. 7), オンライン
- Organized遺伝子の使い回しは多様化にとって諸刃の剣か — 日本分子生物学会 (2020 Dec. 4), 博多
- OrganizedWhat makes animal embryos follow the hourglass model? — 日本生物物理学会 (2019 Sep. 25), 宮崎
- Invited遺伝子の使い回しは進化にとって諸刃の剣か？ — 再生学異分野融合研究会 (2018 Aug. 31), 基生研
- Organized表現型揺らぎから探る進化の方向性と拘束 — 日本進化学会 (2018 Aug. 23), 東京
- Invited複雑な遺伝子制御を持つ動物ほど進化可能性が低いかもしれない — 生命の起源および進化学会 (2018 Mar. 16), 埼玉大学
- 脊索動物胚発生の分子発生システムゆらぎと進化的保存性の関連解明に向けて — 新学術領域 進化制約方向性 キックオフシンポジウム (2017 Oct. 1), 東京大学
- MFID仮説検証を目指した動物実験系の立ち上げ — 母児間免疫病研究会 2017年大会 (2017 Jul. 15), 大阪市立大学
- What are the potential mechanisms that made vertebrates' bauplan conserved? — 日本発生生物学会 50周年記念大会 (2017 May 10), Tokyo
- In search for general law of animal embryonic evolution — International Symposium on Universal Biology (2016 Nov. 28), 東京大学
- Organizedなぜボディプラン進化は保守的なのか — シンポジウム 進化可能性と方向性 日本進化学会 (2016 Aug. 27), 東工大
- Invited動物発生の進化的法則性を求めて — 研究会 物理学的普遍性から生物学的普遍性へ (2016 Aug. 5), 東京
- Invited発生システムが動物ボディプラン進化を制約している可能性 — BMB2015 ワークショップ (2015 Dec. 3), 神戸
- Invited大進化スケールにおける発生進化の法則性と定量的検証 — JSBi生命システム理論研究会 (2015 Nov. 27), 東京医科歯科大学
- Invited動物胚が発生と進化の法則性、砂時計モデルに従うのはなぜか？ — 第53回 生物物理学会年会 (2015 Sep. 14), 金沢
- Organized動物進化と個体発生の統合的理解に向けて — 第37回 分子生物学会 Workshop (2014 Nov. 26), 横浜
- Invited大規模トランスクリプトームから挑む進化発生学の古典問題 — 第86回 日本遺伝学会 年会 (2014 Sep. 19), 長浜
- Invited祖先の姿を反映した発生期？EvoDevoの古典問題と生命情報解析 — 遺伝研研究集会「ゲノム編集時代の分子進化」 (2014 Jun. 28–29), 三島
- Organizedカメも従う動物発生進化の法則性？ — 第36回 分子生物学会 Workshop (2013 Dec. 5), 神戸
- InvitedFlexibility in early animal developmental system — The 2nd International Workshop for Quantitative Biology (2013 Nov. 25), Osaka
- Invited脊椎動物の進化と発生の関係性を解明したい — 京都大学 理学研究科セミナー (2013 Oct. 25), 京都
- Invitedネッタイツメガエル胚発生期の包括的遺伝子発現データ — 第84回 動物学会 (2013 Sep. 28), 岡山
- Invited進化と発生の関係性をさぐるべく、de novo カメゲノム — NGS現場の会 第3回大会 (2013 Sep. 4), 神戸
- Invited個体発生は系統発生を繰りかえさない — 京都大学 再生医科学研究所セミナー (2013 Jul. 22), 京都
- Invitedカメも従う発生進化の法則性 — 新学術領域「複合適応形質進化の遺伝子基盤解明」第6回オープンセミナー (2013 Jun. 1), 富山
- Invitedカメゲノムと脊椎動物ボディプラン — 第60回 日本実験動物学会総会 (2013 May 16), つくば
- Invited発生システムのゆらぎと進化的可変性の理解にむけて — QBiC 定量オミックスワークショップ @OLABB (2013 Jan. 22), 大阪
- Organized進化と発生にどういう関係がある？ — 第35回 分子生物学会 Workshop (2012 Dec. 13), 博多
- Invited「脊椎動物よ、もうその基本ボディプランは変形させられないのか？」 — 生命医薬情報学連合大会合同シンポジウム (2012 Oct. 15–16), 東京
- Invited個体発生と系統発生が示す新たな謎 — 第24回 高遠シンポジウム (2012 Aug. 24), 長野
- Invited大量情報解析技術で挑む進化発生学の古典問題 — NAIST植物グローバル ワークショップ (2012 Jun. 13), 奈良
- Reconsidering the mechanistic view of embryogenesis — Joint Meeting of JSDB 45th & JSCB 64th (2012 May 31), Kobe
- NGS技術で生命史観は変わりますか？〜進化と発生の観点から〜 — 第2回 NGS現場の会 (2012 May 25), Osaka
- Invited大量情報解析から挑む脊椎動物ボディプラン — 第117回日本解剖学会総会 (2012 Mar. 28), 甲府
- Invitedヘッケルの反復説から進化と発生の関係性解明は進んだか？ — 京都大学医学部 生体構造医学セミナー (2012 Jan. 19), 京都
- Invited観念形態学の古典問題に定量化で挑む — 4th Annual meeting of Japanese Society for Quantitative Biology (2012 Jan. 9), Nagoya
- InvitedHaeckel's recapitulation theory? or The developmental hourglass? — 1542nd Biological Symposium at National Institute of Genomics (2011 Nov. 21), Mishima, Japan
- 個体発生と系統発生からみた脊椎動物ボディプラン — 新学術領域研究「複合適応形質進化の遺伝子基盤解明」第2回若手ワークショップ (2011 Oct. 7), 千葉
- 進化発生学の古典問題にバイオインフォマティクスで挑む — 生命情報科学若手の会 沖縄セミナー (2011 Sep. 3), Okinawa
- Invited発生砂時計モデルの証明と脊椎動物EvoDevo最前線 — 大阪大学微生物病研究所 Bridge Seminar (2011 Jun. 17), 大阪
- Invited発生砂時計モデルと脊椎動物がもつ発生学的構造特性への思索 — 東京大学金子研究室 (2011 Jun. 16), 東京
- Invited脊椎動物胚でみつかった進化的に保守的な胚段階 — 神戸大学GCOE セミナー (2011 May 24), 神戸
- InvitedThe developmental hourglass model and early divergence of vertebrate embryos — 44th Annual Meeting of JSDB (2011 May 21), Okinawa
- Testing phylotype hypothesis and structural insights of vertebrate embryogenesis — BMB 2010 (2010 Dec. 7), 神戸
- 脊椎動物ファイロタイプ仮説検証と発生学的構造特性の示唆 — 生命情報科学若手の会 第2回研究会 (2010 Oct. 9), 三島
- 胆道閉鎖症における母児間のHLA一致度 — 第34回日本胆道閉鎖症研究会 (2008 Apr. 20), 名古屋
- 第2回 母児間免疫病勉強会 講演「MFID仮説検証におけるTreg ablationの実験系について」(2010 Mar. 20), 大阪 関西医科大学
- 第1回 母児間免疫病勉強会 講演「現代免疫学〜母児間免疫を中心に〜」(2009 Jun. 19), 大阪 関西医科大学
Research Grants
2023 Apr. – 2025 Mar.
Bilateral Program — JSPS
脊椎動物胚に保存されたボディプラン構成細胞の解明
"Clarifying the cellular components of vertebrate body plan"
脊椎動物胚に保存されたボディプラン構成細胞の解明
"Clarifying the cellular components of vertebrate body plan"
2023 Apr. – 2027 Mar.
Grant-in-Aid for Scientific Research (B) (Principal Investigator) — KAKENHI
ボディプラン解明と動物門の発生学的定義法
"Identification of body plan and developmental re-definition of animal phylum"
ボディプラン解明と動物門の発生学的定義法
"Identification of body plan and developmental re-definition of animal phylum"
2021 Apr. – 2024 Mar.
Challenging Research (Exploratory) (Principal Investigator) — KAKENHI
胎児期に移入する母由来細胞集団の解明とその生物学的意義の探求
"Identification of maternal cell types migrated during development and in search for their biological roles"
胎児期に移入する母由来細胞集団の解明とその生物学的意義の探求
"Identification of maternal cell types migrated during development and in search for their biological roles"
2020 Aug.
Takeda Science Foundation
妊娠期に移入する母由来・非自己細胞の胎仔における細胞種と分布解明
妊娠期に移入する母由来・非自己細胞の胎仔における細胞種と分布解明
2017 Jun. – 2022 Mar.
Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Principal Investigator) — KAKENHI
進化の制約と方向性
"Measuring molecular fluctuations of chordate developmental system and their relationship toward evolutionary conservation"
進化の制約と方向性
"Measuring molecular fluctuations of chordate developmental system and their relationship toward evolutionary conservation"
2017 Apr. – 2020 Mar.
Challenging Research (Exploratory) (Principal Investigator) — KAKENHI
胆道閉鎖症への母児間マイクロキメリズムの関与検証
"Testing possible contribution of maternal microchimeric cells to biliary atresia"
胆道閉鎖症への母児間マイクロキメリズムの関与検証
"Testing possible contribution of maternal microchimeric cells to biliary atresia"
2016 Apr. – 2017 Mar.
The Nakajima Foundation
発生システムのロバスト性評価による、動物発生進化の保守性解明
"Tackling conservative features of animal embryonic evolution by evaluation of developmental robustness"
発生システムのロバスト性評価による、動物発生進化の保守性解明
"Tackling conservative features of animal embryonic evolution by evaluation of developmental robustness"
2015 Nov. – 2019 Mar.
JST Strategic International Collaborative Research Program (SICORP) (Principal Investigator)
棘皮動物と脊索動物の発生プログラムから目指す遺伝的進化度の構築
"Genetic degree of evolution in Echinoderm and Chordate developmental programs"
棘皮動物と脊索動物の発生プログラムから目指す遺伝的進化度の構築
"Genetic degree of evolution in Echinoderm and Chordate developmental programs"
2015 Apr. – 2016 Mar.
Takeda Science Foundation
母児間マイクロキメリズムと先天異常発症
母児間マイクロキメリズムと先天異常発症
2015 Apr. – 2018 Mar.
KAKENHI Grant-in-Aid for Young Scientists (A) (Principal Investigator)
発生時系列ゲノム情報展開から目指す脊索動物胚進化の一般則解明
"In search for a general tendency of chordate embryonic evolution by analyzing genetic expression patterns during development"
発生時系列ゲノム情報展開から目指す脊索動物胚進化の一般則解明
"In search for a general tendency of chordate embryonic evolution by analyzing genetic expression patterns during development"
2013 Aug. – 2017 Mar.
Research & Education Platform for Dynamic Living States
複雑生命システム動態研究教育拠点
複雑生命システム動態研究教育拠点
2012 Apr. – 2015 Mar.
KAKENHI Grant-in-Aid for Scientific Research (C) #24570243 (Principal Investigator)
脊椎動物胚発生の進化発生学的理解を目指す
"In search for a general tendency of chordate embryonic evolution"
脊椎動物胚発生の進化発生学的理解を目指す
"In search for a general tendency of chordate embryonic evolution"
2010 Apr. – 2015 Mar.
Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Co-Investigator)
カメの甲の新規形態パターンをもたらした発生機構の変化
"Changes in developmental program in the acquisition of novel morphological patterns of the turtle shell"
カメの甲の新規形態パターンをもたらした発生機構の変化
"Changes in developmental program in the acquisition of novel morphological patterns of the turtle shell"
2009 Apr. – 2011 Mar.
KAKENHI Grant-in-Aid for Young Scientists (B) (Principal Investigator)
トランスクリプトーム解析によるファイロティピック段階の実体解明
"Identification of vertebrate phylotypic stage by transcriptome analysis"
トランスクリプトーム解析によるファイロティピック段階の実体解明
"Identification of vertebrate phylotypic stage by transcriptome analysis"
2007 Apr. – 2008 Mar.
KAKENHI Grant-in-Aid for Exploratory Research (Co-Investigator)
脊椎動物の発生拘束を担う遺伝子群の同定とその役割
"Identification of genes involved in constrained stages of vertebrates"
脊椎動物の発生拘束を担う遺伝子群の同定とその役割
"Identification of genes involved in constrained stages of vertebrates"
Meetings Organized
2024
第26回 日本進化学会 年会 大会組織委員
The 26th Annual Meeting of Society of Evolutionary Studies, Japan (Organizing Committee)
The 26th Annual Meeting of Society of Evolutionary Studies, Japan (Organizing Committee)
2023
The 3rd AsiaEvo, Scientific Committee, Singapore
2022
第93回 日本動物学会（早稲田大会）大会組織委員
The 93rd Annual Meeting of the Zoological Society, Japan (Organizing Committee)
The 93rd Annual Meeting of the Zoological Society, Japan (Organizing Committee)
2021
The 2nd AsiaEvo, Scientific Committee
2020
日本発生生物学会年会 オンライン大会 準備委員
Online Meeting of the Japanese Society for Developmental Biologists (Organizing Committee)
Online Meeting of the Japanese Society for Developmental Biologists (Organizing Committee)
2020
日本進化学会 オンライン大会 プログラム委員
Online Meeting of the Society of Evolutionary Studies, Japan (Program Committee)
Online Meeting of the Society of Evolutionary Studies, Japan (Program Committee)
2018
The 1st AsiaEvo — 発起人、プログラム委員 (Co-Promoter, Scientific Committee)
2017
第50回 日本発生生物学会年会 準備委員（プログラム委員長）
50th Meeting of the Japanese Society for Developmental Biologists (Chair of Program Committee)
50th Meeting of the Japanese Society for Developmental Biologists (Chair of Program Committee)
2015
第15回 日本進化学会年会 大会準備委員
15th Meeting of Society of Evolutionary Studies, Japan (Organizing Committee)
15th Meeting of Society of Evolutionary Studies, Japan (Organizing Committee)
2013
第36回 日本分子生物学会年会 組織委員
The 36th Annual Meeting of Molecular Biology Society of Japan (Organizing Committee)
The 36th Annual Meeting of Molecular Biology Society of Japan (Organizing Committee)
2012
第35回 日本分子生物学会年会 組織委員（IT委員会）
The 35th Annual Meeting of Molecular Biology Society of Japan (IT Committee)
The 35th Annual Meeting of Molecular Biology Society of Japan (IT Committee)
2012
第2回 NGS現場の会 副大会長
2012
第1回 NGS現場の会 創設メンバー
2008
第1回 母児間免疫病研究会 発起人
1st Meeting of the Materno-Fetal Immune Disease (Co-Promoter)
1st Meeting of the Materno-Fetal Immune Disease (Co-Promoter)
Teaching / Lectures
講義 (Courses)
ミクロマクロ — 総合研究大学院大学 統合進化科学コース (FY2024–)
発生進化生物学 — 総合研究大学院大学 統合進化科学コース (FY2024)
個体ダイナミクスセミナーシリーズ — 東北大学 生命科学研究科 (2023 Oct. 5)
動物発生学実習 — 東京大学 理学部 生物学科 (FY2013–FY2022)
進化発生生物学 — 東京大学 理学部 生物学科 (FY2013–FY2023)
進化生物学 — 東京大学 教養学部前期・後期 (FY2017–FY2022)
現代生物学 — 東京大学 教養学部前期・後期 (FY2017, 2019, 2022)
全学体験ゼミナール — 東京大学 教養学部前期・後期
発生学特論 — 東京大学 大学院理学系研究科 生物科学専攻 (FY2014–2022)
現代の生物学 — 神戸大学 大学院理学系研究科 生物学専攻 (2021 Jun. 11)
個体発生は系統発生を繰り返さない — 鳥取大学 医学部 (2018 Nov. 6)
[Statistics, R] 統計の考え方入門 — 大阪市立大学医学部 (2018 Jul. 15)
Lecture at Kunming Institute of Zoology — "General relationship between ontogeny and phylogeny?" (2015 Sep. 28), Kunming, China
[Statistics, R] 数式なしの統計入門と『R』を使った実際 — ImageJ + R ハンズオン実習2014, NAIST (2014 Jun. 12)
[EvoDevo] 個体発生は系統発生をくりかえさない — 慶應義塾大学 鶴岡キャンパス 概念構築講義 (2014 May 13)
[Bioinformatics] カメ de novo ゲノムとRNAseqデータの異種間比較 — 第27回 DDBJing講習会 (2013 Jul. 4), 三島
[Statistics, R] 数式なしの統計講座、そしてRソフトでの実際 — ハンズオン実習 NAIST (2013 Jul. 6)
[NGS lecture] 新規脊椎動物ゲノム同定とRNAseqによる遺伝子発現プロファイル比較 — 次世代シーケンシングが切り開く医学研究と展望 (2012 Jul. 31), Kyoto University
[Bioinformatics] 統計の初歩の初歩 ~検定はRプログラムで全部できます~ — 入江直樹 インフォマティクスセミナー, 京都大学 (2012 Jan. 19)
[Statistics/Bioinformatics Hands-on] 統計解析ソフトRとその活用 — 生命情報科学若手の会 沖縄セミナー 2011 (2011 Sep. 2)
Basic Medicine, Medical Biology course for pre-med students at Daigakuin-Yobiko (3 classes/week, 2008 Aug. – 2009 Mar.)
Kyoto University Graduate School cross-sectoral study sessions (2008 Feb. 12, 2008 Nov. 14, 2009 Mar. 5)
一般公開講演・メディア出演 (Public Lectures & Media)
学術会議フォーラム — 2040年の科学・学術と社会を見据えて取り組むべき10の課題 (2023 Jul. 2)
NHK BSプレミアム ヒューマニエンス「"出産" ヒトは難産を選んだ」(2020 Apr. 22)
東京大学新聞 (2020 Jun. 2号)
進化発生生物学って何？ — 国際生物オリンピック日本委員会 (2018 Aug. 18), 東京
[フロントランナー挑む] 生物の進化を予測する — 日経サイエンス 2018年6月号
胎児期に刻まれた進化の痕跡 — 関東支部公開講演会「塗り替えられる動物の進化の歴史」(2017 Jul. 22), 東京
聞こう！語ろう！考えよう！ かたちの変化と生きものの進化 — JT生命誌研究館 (2016 Aug. 20), 大阪
第27回東大理学部公開講演会「理学の真実」(2015 Nov. 20); 東京大学 理学部オープンキャンパス2015
National Geographic Nov. 2013; 理化学研究所 参加型サイエンストーク「見出す」物語 2013
Peer Review Experiences
BMC Genomics
Genome Biology and Evolution
Genes to Cells
Evolution & Development
Human Frontier Science Program (Young Investigator Grant)
iScience (Cell Press)
Journal of Experimental Zoology, Part B (Associate Editor)
Journal of Molecular Evolution
Molecular Biology and Evolution
Nature Communications
Nature Genetics
Science
Scientific Reports
Zoological Science
Zoological Letters (Associate Editor)
Memberships
Advisory Roles
2022 – present
Society for Evolutionary Studies, Japan（日本進化学会）
Board Member（理事）
Board Member（理事）
2022 – present
Zoological Society of Japan, Kanto Branch（日本動物学会 関東支部）
Branch Committee Representative（支部代表委員）
Branch Committee Representative（支部代表委員）
2021 – present
The Japanese Society of Developmental Biologists（日本発生生物学会）
Board Member（理事）
Board Member（理事）
2020 – present
日本学術会議（Science Council of Japan）
Member（連携会員）
Member（連携会員）
2020 – present
Center for Excellence in Animal Evolution and Genetics, Chinese Academy of Sciences
International Evaluator（国際外部評価委員）
International Evaluator（国際外部評価委員）
2019 – present
PRESTO "Multicellular system" / さきがけ「多細胞」（JST 戦略的創造研究推進事業）
Advisor（アドバイザー）
Advisor（アドバイザー）
2018 – 2022
Zoological Society of Japan, Kanto Branch（日本動物学会 関東支部）
Committee Member（委員）
Committee Member（委員）
2018 – 2020
Society for Evolutionary Studies, Japan（日本進化学会）
Inspector（監事）
Inspector（監事）
2017 Jan. – present
Journal of Experimental Zoology, Part B
Associate Editor
Associate Editor
2016 Jan. – present
Zoological Letters
Associate Editor
Associate Editor
2016 – 2018
The 1st AsiaEvo Conference
Co-Promoter, Scientific Committee（発起人、プログラム委員）
Co-Promoter, Scientific Committee（発起人、プログラム委員）
2016 Jan. – 2016 Dec.
The Japanese Society of Developmental Biologists（日本発生生物学会）
Secretary-General（幹事長）
Secretary-General（幹事長）
2016 Jan. – 2017 Dec.
Society for Evolutionary Studies, Japan（日本進化学会）
Councilor（評議員）
Councilor（評議員）
2014 Jan. – 2015 Dec.
Society for Evolutionary Studies, Japan（日本進化学会）
Executive Member（執行部）
Executive Member（執行部）
2013 Jan. – 2015 Dec.
The Japanese Society of Developmental Biologists（日本発生生物学会）
Deputy Secretary-General（副幹事長）
Deputy Secretary-General（副幹事長）
2012 Apr. – 2015 Apr.
2010 Jul. – 2015
Faculty of 1000
Associate Faculty
Associate Faculty
2009 – present
Study Group for Materno-Fetal Immune Disease（母児間免疫病研究会）
Co-Promoter（発起人）
Co-Promoter（発起人）
News Papers / Media
テック・アイ研究所 (2022 Nov. 9) — 新生仔に入り込んだ母由来細胞は、免疫の制御に寄与する
日経新聞 (2022 Nov. 4) — 東大、胎児期に移入する母由来細胞種の個体ごとの違いや全貌を解明
日経新聞 (2022 Apr. 22)
NHK ヒューマニエンス「"出産" ヒトは難産を選んだ」— 初回放送日 2021年4月22日
日経サイエンス 2018年6月号 「挑む」p.8–11
日経新聞・財経新聞・Yahoo!ニュース・BIGLOBEニュース・ライブドアニュース・ニフティニュース etc. (2017 Feb. 8)
日経新聞・朝日新聞・毎日新聞・産経新聞・読売新聞・NNNニュース etc. (2013 Apr. 29)
研コミュ白書 NGS現場の会（荒川和晴、入江直樹、谷上賢瑞、中村昇太）— 細胞工学 vol.31 No.9 (2012) p.1060–1063
日本経済新聞（日曜朝刊・科学欄）〜ナゾ科学〜「阿修羅や八岐大蛇、なぜいない？」(2011 Jul. 10)
RIKEN News (2011 Mar. 30)
RIKEN Research Highlights Vol.6 Num.6 (2011 Jun.)
科学新聞 (2011 Apr. 15 夕刊) — 「脊椎動物の進化的に保存された発生段階は咽頭胚期」