職歴・所属
東京大学 生物普遍性研究機構
理化学研究所 発生・再生科学総合研究センター 進化形態研究室
京都大学大学院 医学研究科 先天異常学研究室
学歴
京都大学 大学院医学研究科
京都大学 大学院医学研究科
神戸大学 理学部
論文・著書
査読論文・著書・メディア掲載の一覧は Publicationsページをご覧ください。
口頭発表
国際学会・会議
- 招待Which cell types are more evolutionarily conserved in the vertebrate body plan? — 日本分子生物学会 (2025年12月4日), 横浜
- 招待General tendency in animal embryonic evolution — Light of Evolution Academic Cloud Forum, 北京大学 (2024年12月25日), 北京, 中国
- 招待The hourglass model in comparative transcriptomics — Phylogenetisches Symposium (2024年11月24日), イエナ, ドイツ
- 招待General tendency in animal embryonic evolution and possible mechanisms for limiting phenotypic diversity — Joint seminar: RCIES & Centre for Evolutionary and Organismal Biology (2024年11月6日), 杭州, 中国
- 招待Potential genetic system limiting phenotypic diversification of animals — International Conference of the Genetics Society of Korea / 1st Asia Genetic Consortium Conference (2024年10月19日), 釜山, 韓国
- 招待How early animal embryos diversified despite the following conserved bottleneck phase? — EuroEvoDevo (2024年6月27日), ヘルシンキ
- 招待Filtering aspect of animal embryogenesis toward phenotypic diversification — ICOB Seminar (2024年1月31日), 台湾
- 招待Does the bottle-neck of the developmental hourglass model really define body plan? — The 3rd AsiaEvo (2023年12月17日), シンガポール
- 招待Does the bottle-neck of the developmental hourglass model really define body plan? — ICG-Ocean 2023 (2023年10月28日), 青島, 中国
- 招待Stability and robustness could be contributing to long-term conservation of vertebrates' body plan — Virtual Human Development Project (2023年6月14日), オンライン, カナダ
- 招待Organismal intrinsic factors possibly limiting evolutionary diversification — Determinants of Rates of Origination, Extinction and Evolution (2022年6月28日), オスロ, ノルウェー
- 招待Possible intrinsic factors limiting animal body plan diversification — JSDB–Singapore Developmental Biology Society Joint Meeting (2022年5月30日), オンライン
- 主催Can we predict evolutionary outcome of animal body plan? — International Congress of Zoology (2021年11月24日), ケープタウン, 南アフリカ(オンライン)
- 招待Internal factors of biological system that biases evolutionary outcome — ICG-16 (2021年10月28日), 青島(オンライン)
- 招待Possible constraints by developmental robustness — AsiaEvo (2021年8月16日), 東京(オンライン)
- 招待(基調)Developmental robustness may bias macroevolutionary outcome — 17th Spanish Society for Developmental Biology Meeting (2020年11月19日), スペイン(オンライン)
- 主催Potential double-edged sword effect of gene re-usage toward evolutionary diversification — 日本分子生物学会 Workshop (2019年12月4日), 博多
- 招待Possible bias toward micro- and macro-evolutionary conservation by developmental systems — Workshop: Reconciling Micro-Macro Evolution (2019年10月28日), オスロ, ノルウェー
- 招待Do echinoderm embryos follow hourglass-like divergence? — ICG-Ocean 2019 (2019年9月22日), 青島, 中国
- 招待Haeckel's recapitulation theory refuted by the hourglass model? — 112th Annual Meeting of the German Zoological Society, イエナ, ドイツ (2019)
- 招待(基調)Development and Evolution — SERB School in Evolutionary Biology (2019年3月14日), ベンガルール, インド
- 招待(基調)The developmental hourglass model in animal embryogenesis — Developmental Biology of Sea Urchin and other Marine Invertebrates 2018 (2018年10月19日), ウッズホール, USA
- 招待"Cost of complexity" contributed to the vertebrate body plan conservation? — Euro EvoDevo 2018 (2018年6月26日), ゴールウェイ, アイルランド
- 招待Gene re-usages constrained the evolvability of animal body plan? — EvoDevo Seminar Series, ケンブリッジ大学 (2018年5月16日), UK
- 主催"Cost of complexity" hypothesis supported in animal embryonic evolution? — The 1st AsiaEvo Conference (2018年4月18日), 深圳, 中国
- 招待In search for a general law of animal embryonic evolution — 12th International Workshop on Advanced Genomics (2017年6月29日), 東京
- 主催What are the potential mechanisms that made vertebrates' body plan conserved? — 日本発生生物学会50周年記念大会 (2017年5月10日), 東京
- 招待The developmental hourglass model: the law of embryonic evolution? — From Genetic Networks to a Cellular Wiring Diagram (2017年4月26日), 東京
- 主催What makes vertebrate embryos follow the hourglass-like conservation? — ICZ & Zoological Society of Japan Joint Meeting (2016年11月18日), 沖縄
- 招待Why are vertebrates' organogenesis stages evolutionarily conservative? — Hot Spring Harbor Symposium (2016年11月2日), 博多
- Possible constraints on phenotypic evolvability of vertebrates — 1st B10K Project Meeting (2016年10月27日), 北京
- Potential developmental constraints on vertebrate body plan evolution — EuroEvoDevo (2016年7月28日), ウプサラ, スウェーデン
- 招待How can we explain conservative evolution of vertebrates' body plan? — Boston University (2016年4月11日), ボストン, USA
- 主催Potential double-bladed aspect of gene recruitment to morphological evolution — Japan Q-bio Week (2016年1月11日), 東京
- 招待In search for more ancestral embryos — CDB Symposium 2015 (2015年3月25日), 神戸
- 招待Is the hourglass model, a unified theory of Evo-Devo? — OIST Winter Course (2014年12月12日), 沖縄
- Evolutionary meanings of fish-like stages in our embryogenesis — Japan-Chile JSPS Symposium (2014年11月4日), サンティアゴ
- Easily changed early embryogenesis? — X Meeting, Spanish Society for Developmental Biology (2014年10月14日), マドリード
- Remaining questions of the developmental hourglass model — Euro EvoDevo 2014 (2014年7月24日), ウィーン
- General rule for the relationship between vertebrate ontogeny and phylogeny? — Harvard University (2014年3月28日), ボストン
- 招待Turtle also follows the general formulation of embryonic evolution — ICG-8 (2013年10月31日), 深圳
- 招待Vertebrates' basic body plan embedded in the waist of the hourglass — 日本進化学会第15回年会 (2013年8月29日), つくば
- Vertebrate phylotypic period as a source of basic body plan — ISDB Conference 2013 (2013年6月19日), カンクン
- 主催Turtle Genomes: Body Plan Evolution from Vertebrate Phylotype — Plant and Animal Genome Conference Asia 2013 (2013年3月18日), シンガポール
- 招待What the Hourglass tells us about Vertebrate Development and Evolution — CDB Symposium 2013 (2013年3月4日), 神戸
- 招待Relationship between Ontogeny and Phylogeny of vertebrates — German-Japan Colloquium (2013年1月31日), カールスルーエ
- 招待Re-formulating the Relationship Between Evolution and Development — 7th International Conference on Genomics & Bio-IT APAC 2012 (2012年11月30日), 香港
- 招待Flexibility in early development? — CAS-MPG Partner Institute Seminar (2012年7月24日), 上海
- Molecular verification of the developmental hourglass model — Euro Evo-Devo 2012 (2012年7月11日), リスボン
- 招待Transcriptome comparisons provide evolutionary clues for the vertebrate body plan — Sanger Institute Seminar (2011年9月14日), ケンブリッジ
- 招待Transcriptome similarity reveals developmental basis for vertebrate body plan — SMBE 2011 (2011年7月30日), 京都
国内学会・研究会
- 招待動物進化は変幻自在ではない・・けど、なぜ?? — 北里大学 理学部セミナー (2025年11月13日)
- 招待動物発生過程と情報科学からみた進化可能性とその課題 — 「進化可能性変動史」セミナーシリーズ 第一回 (2025年11月5日)
- 招待なぜ動物の体の基本構造は進化的に変わりにくい? — 東北大学 個体ダイナミクスセミナーシリーズ (2023年10月5日)
- 招待脊椎動物に保存された発生機構を制御するシグナル伝達ネットワーク — 日本毒性学会 年会 (2023年6月20日), パシフィコ横浜
- 招待個体発生と系統発生(進化)の一般則解明からみえてきた"縛り" — 名古屋大学理学部 GTRセミナー (2022年12月21日)
- 招待maternal microchimerism:マウスにおける動物実験モデル — 母児間免疫病研究会 (2022年7月23日), オンライン
- 招待表現型進化は生物に内在する要因により制限される? — 葉山セミナー (2022年7月1日), SOKENDAI
- 招待動物の解剖学的基本パターンはなぜ進化的に保守的なのか — 第127回日本解剖学会総会 (2022年3月27日), オンライン
- 主催動物表現型進化の予測にむけて — ExCELLS シンポジウム (2020年12月21日), オンライン
- 主催発生頑健性による進化の慣性力 — 日本分子生物学会 (2021年12月1日), 横浜
- 招待現代の生物学I — 神戸大学 大学院生物専攻特別講義 (2021年7月11日), 神戸(オンライン)
- 主催動物ボディプランにみられる進化的慣性力の仕組みは? — 日本進化学会年会 (2020年9月7日), オンライン
- 主催遺伝子の使い回しは多様化にとって諸刃の剣か — 日本分子生物学会 (2020年12月4日), 博多
- 主催What makes animal embryos follow the hourglass model? — 日本生物物理学会 (2019年9月25日), 宮崎
- 招待遺伝子の使い回しは進化にとって諸刃の剣か? — 再生学異分野融合研究会 (2018年8月31日), 基生研
- 主催表現型揺らぎから探る進化の方向性と拘束 — 日本進化学会 (2018年8月23日), 東京
- 招待複雑な遺伝子制御を持つ動物ほど進化可能性が低いかもしれない — 生命の起源および進化学会 (2018年3月16日), 埼玉大学
- 脊索動物胚発生の分子発生システムゆらぎと進化的保存性の関連解明に向けて — 新学術領域 進化制約方向性 キックオフシンポジウム (2017年10月1日), 東京大学
- MFID仮説検証を目指した動物実験系の立ち上げ — 母児間免疫病研究会 2017年大会 (2017年7月15日), 大阪市立大学
- 主催なぜボディプラン進化は保守的なのか — シンポジウム 進化可能性と方向性 日本進化学会 (2016年8月27日), 東工大
- 招待動物発生の進化的法則性を求めて — 研究会 物理学的普遍性から生物学的普遍性へ (2016年8月5日), 東京
- 招待発生システムが動物ボディプラン進化を制約している可能性 — BMB2015 ワークショップ (2015年12月3日), 神戸
- 招待大進化スケールにおける発生進化の法則性と定量的検証 — JSBi生命システム理論研究会 (2015年11月27日), 東京医科歯科大学
- 招待動物胚が発生と進化の法則性、砂時計モデルに従うのはなぜか? — 第53回 生物物理学会年会 (2015年9月14日), 金沢
- 主催動物進化と個体発生の統合的理解に向けて — 第37回 分子生物学会 Workshop (2014年11月26日), 横浜
- 招待大規模トランスクリプトームから挑む進化発生学の古典問題 — 第86回 日本遺伝学会 年会 (2014年9月19日), 長浜
- 招待祖先の姿を反映した発生期?EvoDevoの古典問題と生命情報解析 — 遺伝研研究集会「ゲノム編集時代の分子進化」 (2014年6月28–29日), 三島
- 主催カメも従う動物発生進化の法則性? — 第36回 分子生物学会 Workshop (2013年12月5日), 神戸
- 招待脊椎動物の進化と発生の関係性を解明したい — 京都大学 理学研究科セミナー (2013年10月25日), 京都
- 招待ネッタイツメガエル胚発生期の包括的遺伝子発現データ — 第84回 動物学会 (2013年9月28日), 岡山
- 招待進化と発生の関係性をさぐるべく、de novo カメゲノム — NGS現場の会 第3回大会 (2013年9月4日), 神戸
- 招待個体発生は系統発生を繰りかえさない — 京都大学 再生医科学研究所セミナー (2013年7月22日), 京都
- 招待カメも従う発生進化の法則性 — 新学術領域「複合適応形質進化」第6回オープンセミナー (2013年6月1日), 富山
- 招待カメゲノムと脊椎動物ボディプラン — 第60回 日本実験動物学会総会 (2013年5月16日), つくば
- 主催進化と発生にどういう関係がある? — 第35回 分子生物学会 Workshop (2012年12月13日), 博多
- 招待「脊椎動物よ、もうその基本ボディプランは変形させられないのか?」 — 生命医薬情報学連合大会合同シンポジウム (2012年10月15–16日), 東京
- 招待個体発生と系統発生が示す新たな謎 — 第24回 高遠シンポジウム (2012年8月24日), 長野
- 招待大量情報解析技術で挑む進化発生学の古典問題 — NAIST 植物グローバルワークショップ (2012年6月13日), 奈良
- 招待大量情報解析から挑む脊椎動物ボディプラン — 第117回日本解剖学会総会 (2012年3月28日), 甲府
- 招待ヘッケルの反復説から進化と発生の関係性解明は進んだか? — 京都大学医学部 生体構造医学セミナー (2012年1月19日), 京都
- 招待観念形態学の古典問題に定量化で挑む — 4th Annual meeting of Japanese Society for Quantitative Biology (2012年1月9日), 名古屋
- 招待発生砂時計モデルの証明と脊椎動物EvoDevo最前線 — 大阪大学微生物病研究所 Bridge Seminar (2011年6月17日), 大阪
- 招待脊椎動物胚でみつかった進化的に保守的な胚段階 — 神戸大学GCOE セミナー (2011年5月24日), 神戸
- 胆道閉鎖症における母児間のHLA一致度 — 第34回日本胆道閉鎖症研究会 (2008年4月20日), 名古屋
- 第2回 母児間免疫病勉強会 講演「MFID仮説検証におけるTreg ablationの実験系について」(2010年3月20日), 大阪
- 第1回 母児間免疫病勉強会 講演「現代免疫学〜母児間免疫を中心に〜」(2009年6月19日), 大阪
研究費・助成金
脊椎動物胚に保存されたボディプラン構成細胞の解明
ボディプラン解明と動物門の発生学的定義法
胎児期に移入する母由来細胞集団の解明とその生物学的意義の探求
妊娠期に移入する母由来・非自己細胞の胎仔における細胞種と分布解明
進化の制約と方向性:脊索動物発生システムの分子ゆらぎと進化的保存性の関連解明
胆道閉鎖症への母児間マイクロキメリズムの関与検証
発生システムのロバスト性評価による、動物発生進化の保守性解明
棘皮動物と脊索動物の発生プログラムから目指す遺伝的進化度の構築
母児間マイクロキメリズムと先天異常発症
発生時系列ゲノム情報展開から目指す脊索動物胚進化の一般則解明
脊椎動物胚発生の進化発生学的理解を目指す
カメの甲の新規形態パターンをもたらした発生機構の変化
トランスクリプトーム解析によるファイロティピック段階の実体解明
脊椎動物の発生拘束を担う遺伝子群の同定とその役割
学会・研究会の組織
教育・講義
講義・授業
ミクロマクロ — 総合研究大学院大学 統合進化科学コース(FY2024–)
発生進化生物学 — 総合研究大学院大学 統合進化科学コース(FY2024)
個体ダイナミクスセミナーシリーズ — 東北大学 生命科学研究科(2023年10月5日)
動物発生学実習 — 東京大学 理学部 生物学科(FY2013–FY2022)
進化発生生物学 — 東京大学 理学部 生物学科(FY2013–FY2023)
進化生物学 — 東京大学 教養学部前期・後期(FY2017–FY2022)
現代生物学 — 東京大学 教養学部前期・後期(FY2017, 2019, 2022)
全学体験ゼミナール — 東京大学 教養学部前期・後期
発生学特論 — 東京大学 大学院理学系研究科 生物科学専攻(FY2014–2022)
現代の生物学 — 神戸大学 大学院理学系研究科 生物学専攻(2021年6月11日)
個体発生は系統発生を繰り返さない — 鳥取大学 医学部(2018年11月6日)
[統計, R] 統計の考え方入門 — 大阪市立大学医学部(2018年7月15日)
Lecture at Kunming Institute of Zoology(2015年9月28日), 昆明, 中国
[統計, R] 数式なしの統計入門と『R』を使った実際 — ImageJ + R ハンズオン実習2014, NAIST(2014年6月12日)
[EvoDevo] 個体発生は系統発生をくりかえさない — 慶應義塾大学 鶴岡キャンパス 概念構築講義(2014年5月13日)
[バイオインフォマティクス] カメ de novo ゲノムとRNAseqデータの異種間比較 — 第27回 DDBJing講習会(2013年7月4日)
[統計, R] 数式なしの統計講座、そしてRソフトでの実際 — ハンズオン実習 NAIST(2013年7月6日)
[NGS] 新規脊椎動物ゲノム同定とRNAseqによる遺伝子発現プロファイル比較 — 次世代シーケンシングが切り開く医学研究と展望(2012年7月31日), 京都大学
[統計/バイオインフォ] 統計の初歩の初歩 ~検定はRプログラムで全部できます~ — 入江直樹 インフォマティクスセミナー, 京都大学(2012年1月19日)
[統計解析/ハンズオン] 統計解析ソフトRとその活用 — 生命情報科学若手の会 沖縄セミナー 2011(2011年9月2日)
Basic Medicine, Medical Biology course for pre-med students at Daigakuin-Yobiko(2008年8月 – 2009年3月, 週3コマ)
京都大学大学院 合同セミナー(2008年2月12日, 2008年11月14日, 2009年3月5日)
一般公開講演・メディア出演
学術会議フォーラム — 2040年の科学・学術と社会を見据えて取り組むべき10の課題(2023年7月2日)
NHK BSプレミアム ヒューマニエンス「"出産" ヒトは難産を選んだ」(初回放送:2021年4月22日)
東京大学新聞(2020年6月2号)
進化発生生物学って何? — 国際生物オリンピック日本委員会(2018年8月18日), 東京
[フロントランナー挑む] 生物の進化を予測する — 日経サイエンス 2018年6月号
胎児期に刻まれた進化の痕跡 — 関東支部公開講演会「塗り替えられる動物の進化の歴史」(2017年7月22日), 東京
聞こう!語ろう!考えよう! かたちの変化と生きものの進化 — JT生命誌研究館(2016年8月20日), 大阪
第27回東大理学部公開講演会「理学の真実」(2015年11月20日); 東京大学理学部オープンキャンパス2015
National Geographic 2013年11月号; 理化学研究所 参加型サイエンストーク「見出す」物語 2013
査読経験
学会所属
委員・役職
理事
支部代表委員
理事
連携会員
国際外部評価委員
アドバイザー
監事
Associate Editor
Associate Editor
発起人・プログラム委員
幹事長
評議員
執行部
副幹事長
コアメンバー
Associate Faculty
発起人
新聞・メディア
テック・アイ研究所(2022年11月9日)— 新生仔に入り込んだ母由来細胞は、免疫の制御に寄与する
日経新聞(2022年11月4日)— 東大、胎児期に移入する母由来細胞種の個体ごとの違いや全貌を解明
日経新聞(2022年4月22日)
NHK ヒューマニエンス「"出産" ヒトは難産を選んだ」— 初回放送日 2021年4月22日
日経サイエンス 2018年6月号「挑む」p.8–11
日経新聞・財経新聞・Yahoo!ニュース・BIGLOBEニュース・ライブドアニュース・ニフティニュース etc.(2017年2月8日)
日経新聞・朝日新聞・毎日新聞・産経新聞・読売新聞・NNNニュース etc.(2013年4月29日)
研コミュ白書 NGS現場の会(荒川和晴、入江直樹、谷上賢瑞、中村昇太)— 細胞工学 vol.31 No.9(2012)p.1060–1063
日本経済新聞(日曜朝刊・科学欄)〜ナゾ科学〜「阿修羅や八岐大蛇、なぜいない?」(2011年7月10日)
RIKEN Research Highlights Vol.6 Num.6(2011年6月)
科学新聞(2011年4月15日夕刊)— 「脊椎動物の進化的に保存された発生段階は咽頭胚期」